После загрузки ОС должен выполняться стартовый (сразу после загрузки) и периодический (один раз в неделю) контроль целостности ПО, входящего в состав СКЗИ, ОС, прикладного ПО и ПО программного средства (состав приведен в п.1.4 настоящего Руководства) с использованием утилиты «cpverify». Возможно использование утилиты «jcverify» из состава программного средства. Если проверка целостности перечисленных компонентов завершается ошибкой, Администратор безопасности должен выявить причину и обстоятельства нарушения целостности ПО и переустановить ПО в соответствии с инструкцией по установке, описанной в Руководстве администратора безопасности для используемой программно-аппаратной платформы.

При использовании СКЗИ «КриптоПро CSP» исполнения 2-Base дополнительно должен быть реализован контроль целостности перечисленных объектов ПО с использованием модуля доверенной загрузки. Контроль должен выполняться до загрузки ОС.